Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NMBRP28336 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms