Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB4P28070 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms