Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA3P26006 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms