Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms