Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRDP23468 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRDP23468 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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