Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF1P22415 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF1P22415 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF1P22415 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF1P22415 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USF1P22415 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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