Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1P21675 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1P21675 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF1P21675 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF1P21675 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF1P21675 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF1P21675 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms