Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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