Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM21P19474 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM21P19474 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms