Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD53P19397 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD53P19397 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD53P19397 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms