Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DESP17661 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DESP17661 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms