Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB4P16144 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms