Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms