Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms