Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMP1P11279 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMP1P11279 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms