Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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