Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGF1P05230 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF1P05230 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF1P05230 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms