Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOA1P02647 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
APOA1P02647 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms