Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHG1P01857 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms