Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFNB1P01574 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNB1P01574 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms