Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX4O95219 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX4O95219 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms