Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5O75197 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5O75197 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP5O75197 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP5O75197 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP5O75197 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP5O75197 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP5O75197 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP5O75197 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP5O75197 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP5O75197 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms