Protein–RNA interactions for Protein: O75191

XYLB, Xylulose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLBO75191 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XYLBO75191 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XYLBO75191 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XYLBO75191 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XYLBO75191 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XYLBO75191 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XYLBO75191 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XYLBO75191 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XYLBO75191 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XYLBO75191 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XYLBO75191 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms