Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPLO60437 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPLO60437 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPLO60437 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPLO60437 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPLO60437 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms