Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLIN1O60240 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLIN1O60240 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms