Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms