Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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