Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOLGA8SH3BPF8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms