Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB9F8W1W9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms