Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms