Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HHLA1C9JL84 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms