Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A8MVJ9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms