Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VGLL3A8MV65 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms