Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NPIPB13A6NJU9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NPIPB13A6NJU9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NPIPB13A6NJU9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NPIPB13A6NJU9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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