Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMX3A6NHT5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX3A6NHT5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms