Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP73A6NFT4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms