Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms