Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAD1L1Q9Y6D9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MAD1L1Q9Y6D9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAD1L1Q9Y6D9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAD1L1Q9Y6D9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms