Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHLDA3Q9Y5J5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms