Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP3Q9Y2W7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms