Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF1Q9UMS5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF1Q9UMS5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF1Q9UMS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms