Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDRG4Q9ULP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDRG4Q9ULP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms