Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNH3Q9ULD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNH3Q9ULD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNH3Q9ULD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms