Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP5Q9UJQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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