Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NKX1-2Q9UD57 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX1-2Q9UD57 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX1-2Q9UD57 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms