Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf48Q9UBA6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
C6orf48Q9UBA6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C6orf48Q9UBA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms