Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT4Q9P109 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT4Q9P109 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT4Q9P109 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT4Q9P109 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT4Q9P109 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCNT4Q9P109 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT4Q9P109 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT4Q9P109 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms