Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN3BQ9NY72 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN3BQ9NY72 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms