Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC28Q9NX36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAJC28Q9NX36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAJC28Q9NX36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.7 ms