Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC3Q9NUD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC3Q9NUD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC3Q9NUD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms